Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms