Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYD88Q99836 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms