Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms