Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TCF12Q99081 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms