Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPS6KC1Q96S38 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms