Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms