Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL15Q96M94 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL15Q96M94 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms