Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCZQ96LD1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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