Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms