Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5RAP3Q96JB5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms