Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms