Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms