Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NXNL1Q96CM4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms