Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP4Q969X6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms