Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms