Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAMP4Q969E2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAMP4Q969E2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms