Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHMTQ93088 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms