Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOPBP1Q92547 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms