Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGP1Q92546 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms