Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms