Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms