Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms