Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC148Q8NFR7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms