Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST4Q8NCG5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST4Q8NCG5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST4Q8NCG5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST4Q8NCG5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST4Q8NCG5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST4Q8NCG5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST4Q8NCG5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST4Q8NCG5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms