Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms