Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms