Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms