Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVOPQ8N4V2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVOPQ8N4V2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms