Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC117Q8IWD4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC117Q8IWD4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms