Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms