Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HECW1Q76N89 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms