Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms