Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms