Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SYNE3Q6ZMZ3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE3Q6ZMZ3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms