Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms