Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms