Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms