Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms