Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP9Q5VTM2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms