Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms