Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms