Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC39AQ5SRH9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms