Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms