Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms