Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC178Q5BJE1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms