Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms