Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LACTB2Q53H82 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LACTB2Q53H82 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms