Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms