Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PKDCCQ504Y2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms