Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GREB1Q4ZG55 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GREB1Q4ZG55 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms